一般情况下，13岁女孩孕酮低，可能是饮食不当、不良生活习惯、黄体功能不全、卵泡生长发育障碍、卵巢肿瘤等原因引起，可以结合引起的原因通过调整饮食、调整作息、口服药物治疗、静脉滴注药物治疗、手术治疗等措施。建议及时就医，在医生指导下给予相应的治疗措施。具体分析如下：
1、饮食不当：如果女孩长期挑食或者长期偏食等，可能会导致营养摄入不足，便无法合成身体所需的孕酮。需要对饮食做出调整，建议多吃一些富含蛋白质丰富的食物，如牛奶、鸡蛋、瘦肉等，同时也要多吃一些含雌激素丰富的食物，如豆腐、腐竹、黄豆等。
2、不良生活习惯：如果女孩经常熬夜或者经常黑白颠倒，可能会导致体内的激素水平发生变化。需要对作息作出调整，建议每天晚上10点前睡觉，而且要保证8小时以上的睡眠时间。
3、黄体功能不全：如果孕酮低比较严重，可以遵医嘱口服黄体酮胶囊、地屈孕酮片、戊酸雌二醇片等药物进行治疗，这些药物可以改善黄体功能不全或卵巢功能减退。
4、卵泡生长发育障碍：如果以上治疗效果不理想，或者女孩卵泡生长发育障碍，导致黄体功能不全，继而影响孕酮分泌。可以遵医嘱通过黄体酮注射液、人绒毛膜注射液、复方氨基酸注射液等药物治疗。
5、卵巢肿瘤：如果是因卵巢肿瘤导致的孕酮低，就需要遵医嘱通过手术的方式治疗，如腹腔镜微创手术，该手术损伤较小，恢复较快，可以最大可能的将卵巢囊肿切除。
女孩在接受医生治疗期间，需要积极配合医生，有利疾病控制。如果因疾病产生不良情绪，可以通过和他人沟通、听歌等方式缓解。
