胃肠镜做多了一般不会对身体有影响，部分患者可能出现黏膜损伤、出血、麻醉风险、穿孔等。
1、一般不会对身体有影响：部分胃病患者需要随访，例如胃息肉、胃炎伴不典型增生等癌前病变等，通过定期复查，预防癌前病变。一般是安全的，不需要焦虑、紧张。
2、黏膜损伤：胃镜是经口进入胃当中，可能造成咽部黏膜擦伤，可有明显疼痛感觉，经过一段时间可恢复正常。肠镜是从肛门肠道，也可能会对肠道黏膜擦伤或损伤，肠道黏膜损伤严重，可引起肠炎。
3、出血：尤其是取活检时，可能会导致局部出血。肠镜下行活检、切息肉等，同样可能导致出血等。一般出血量较小，给予奥美拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑等。
4、麻醉风险：部分患者可能有麻醉药过敏、麻醉药中毒等，表现为心率增快、血压降低、呼吸困难等。
5、穿孔：胃肠镜检查过程中，极少数患者有出现胃穿孔、肠穿孔的风险，患者会出现剧烈的疼痛。这种情况比较严重，可导致剧烈腹痛，立即手术治疗。
此外，胃肠镜检查还有可能导致低氧血症、吸入性肺炎等影响。一般情况下做胃肠镜是比较安全的。通过胃肠镜检查可以观察到食管、胃部和肠道是否有病变，包括食管病变、胃炎、胃溃疡、胃内占位性病变、肠炎肠息肉等，根据检查的结果可以为临床的治疗指明方向。
