输卵管通水后小腹疼痛，可能是由于手术刺激、输卵管不通或通而不畅、子宫内膜炎、盆腔炎等原因导致的。不同的原因处理方法不同，建议及时去医院就诊，明确具体病因后，谨遵医嘱对因治疗，具体情况分析如下：
1、手术刺激：在进行输卵管通水的过程当中，液体通过输卵管有可能会引起输卵管扩张，导致小腹疼痛症状，除此之外，没有其他不适症状，多属于正常生理现象，不需要治疗。
2、输卵管不通或通而不畅：输卵管通水后，如果存在输卵管不通或通而不畅现象时，会对输卵管造成刺激，引起下腹部疼痛症状，建议采用微波理疗的方法治疗改善症状，但有时还需要宫腹腔镜联合治疗。
3、子宫内膜炎：对于患有子宫内膜炎的女性，在输卵管通水后，液体通过输卵管流入到盆腔内时，也会对病灶组织造成刺激从而出现小腹疼痛症状，但同时还可能会伴有腰酸、性交疼痛等症状。建议在医生指导下使用黄体酮胶囊、米非司酮片、地屈孕酮片等药物治疗。
4、盆腔炎：女性在进行输卵管通水后，如果不注意卫生、过早性交等，有可能会导致病原菌侵入盆腔，对盆腔组织造成损伤，进而引起炎症反应，出现通水后肚子疼、分泌物增多、有异味、腰骶部酸痛等症状。建议在医生指导下使用甲硝唑片、阿莫西林胶囊、盐酸左氧氟沙星片等药物治疗，同时也可以对下腹部进行热敷，促进炎症吸收，改善症状。
