吃阿莫西林头疼，可能是生理性原因、药物过敏、病毒性感染、颈椎病、偏头痛等原因导致。建议到医院就诊，配合医生查明原因，采取相关检查和治疗。具体如下：
1、生理性原因：可能是由于对药物的恐惧导致精神过度紧张，可能会出现轻微头疼症状。一般为一过性的头疼，当精神恢复正常后，症状会自行缓解，应避免对吃药恐惧。
2、药物过敏：如果对阿莫西林过敏，在吃药以后有可能会出现过敏症状，一般表现为皮肤瘙痒、起皮疹等，但也有可能会出现头疼症状。通常需要停止继续吃药，并遵医嘱吃抗过敏药物治疗，例如盐酸西替利嗪片、氯雷他定片、马来酸氯苯那敏片等，可减轻过敏反应。
3、病毒感染：可能是由于发生了病毒感染，由于病毒在体内产生大量毒素，会吸入血液，对机体造成刺激，引发头疼、发热等症状。一般需遵医嘱服用抗病毒药物治疗，例如利巴韦林片、抗病毒口服液、四季抗病毒合剂等，可以抑制体内的病毒复制。并且应多喝水，建议每天喝2000ml左右的水，有助于促进体内的新陈代谢，从而排出毒素。
4、颈椎病：一般和吃阿莫西林没有太大关系，可能是由于患有颈椎病，由于颈椎间盘发生突出，会对神经根造成压迫，导致脑供血不足引起头疼、头晕等症状。主要采取按摩的治疗方法，按摩时主选穴位有风池穴、秉风穴、风府穴等，按摩时可使用大拇指指腹进行点按，每穴点按2~3分钟。也可以采取针灸的治疗方法，对风池穴、天柱穴、大椎穴等穴位进行针刺。
5、偏头痛：可能是精神刺激或环境因素等导致的，在吃阿莫西林时，如果偏头痛发作就会引起一侧头痛或双侧剧烈性头疼。可遵医嘱服用非甾体抗炎药，例如布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片、对乙酰氨基酚片等，可起到消炎镇痛的作用。并对头部进行按摩，一般是按摩太阳穴和百会穴，可促进经络循环，改善症状。
除上述原因外，也有可能是神经衰弱、高血压等引起的。在出现头疼症状时应及时休息，避免继续活动，保证充足的睡眠时间，可在一定程度上改善症状。
