上下颚咬合耳根处疼痛可能是颞下颌关节紊乱综合征、根尖周炎、中耳炎、智齿冠周炎、淋巴结炎等原因导致，需要根据引起的原因制定合理的治疗方案。
1.颞下颌关节紊乱综合征：主要是长期单侧咀嚼、外伤或者咬合关系紊乱等因素引起。除了会导致颞下颌关节区出现疼痛外，还可能伴有开口受限、弹响或杂音等症状。需要遵医嘱服用非甾体类消炎止痛药，如布洛芬缓释胶囊、洛索洛芬钠片等。症状较重时，可采取离子导入、电刺激等方式进行治疗。
2.根尖周炎：通常由于细菌感染引起，炎症可刺激周围组织，导致上下颚咬合耳根处疼痛。需要遵医嘱用抗生素类药物治疗，如阿莫西林胶囊、头孢地尼分散片等，症状严重时，需要通过根管治疗的方法治疗。
3.中耳炎：上下颚咬合时会刺激耳根处，当细菌感染侵入咽鼓管诱发中耳炎症时，就会导致上下颚咬合时产生疼痛感，通常还会伴随耳痛、耳鸣、听力下降等症状。需要在医生指导下使用消炎药，如左氧氟沙星滴耳液、头孢拉定片等缓解炎症。还要保持耳道清洁干燥，避免进水。
4.智齿冠周炎：智齿冠周炎常出现牙龈红肿、溢脓，局部压痛。由于智齿位置靠近耳根处，所以智齿冠周炎常会放射至耳根处疼痛。该症状主要以局部冲洗上药为主，可在医生指导下服用抗生素等药物，若智齿位置不正或反复发炎，就要拔除智齿。
5.淋巴结发炎：耳根部位的淋巴结受到炎症感染，可能导致肿胀或疼痛。需要在医生指导下使用抗菌、解热镇痛及抗病毒类药物治疗。
若疼痛持续不减或加重，就需要及时就诊，以便医生根据具体情况进行诊断和治疗。
