女性感染衣原体，根据感染的部位不同，所出现的症状也不一样，常见的症状包括阴道分泌物异常和出血、尿路刺激症、肺部感染、眼部感染等。
1、阴道分泌物异常和出血：女性生殖道系统的感染，包括盆腔炎、宫颈炎等，出现白带分泌物增加，伴有脓性分泌物，阴道口和尿道口充血、发红，脓性的分泌物和浆液性黏液分泌物等。阴道出血，感染衣原体之后，出现宫颈黏膜水肿、充血，会在过性生活中反复摩擦，形成局部的出血、溃破。可以遵医嘱用罗红霉素片、阿奇霉素片等抗炎治疗。
2、尿路刺激症：能够引起非细菌性的尿道炎，症状包括尿痛、尿频、尿急、排尿困难、尿道发痒、尿道口有黏性分泌物等。可以在医生的指导下用盐酸环丙沙星、诺氟沙星胶囊等来治疗。
3、肺部的感染：主要症状如发热、刺激性的干咳、咽痛等。临床上主要是用阿奇霉素片、罗红霉素胶囊等大环内酯类药物来治疗。
4、眼部的感染：症状主要是包括怕光、流泪、眼睛有异物感、眼睛发红等，可以遵医嘱用氧氟沙星滴眼液等来治疗。
另外，女性衣原体感染还可能会导致输卵管黏连堵塞，进而导致女性不孕不育症，这种情况则需要做输卵管通液术等治疗。
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