连花清瘟胶囊/颗粒是在中医络病理论的指导下开发的具有代表性的中成药，用于治疗病毒性呼吸系统传染病、甲流、新冠肺炎等疫情防控发挥重要作用。连花清瘟作为国家中医药“三方三药”的重大成果之一，已被列入国家卫生委员会《新型冠状病毒诊疗方案》(试行第四/五/六/七/八/九版)和国家中医药管理局《新冠肺炎感染者家庭中医药干预指引》。国家权威指南共识推荐病毒呼吸系统传染病用药30余次，成为应对呼吸系统公共卫生事件的品牌中成药。应用广泛，用药安全，疗效准确，在我国和世界新冠肺炎疫情防控中发挥了积极作用。
临床前安全评价结果表明，连花清瘟在急性毒理、长期毒理、安全药理等方面具有良好的安全性，无肝肾功能损伤。根据《中医药新药研究指南》要求的单次毒性试验和一个月的长期毒性试验结果，连花清瘟对大鼠的一般情况、体重、血象、生化指标和主要器官都没有明显影响，肝肾功能也没有异常反应。急性毒性实验研究结果表明，连花清瘟给药大鼠剂量达到18g/kg，相当于人类临床剂量的453倍，没有与药物相关的毒性反应。在长期毒性研究中，剂量相当于人类临床剂量的24倍和145倍，狗和大鼠连续给药4周，无不良反应。安全药理学研究表明，连花清瘟对心血管系统、呼吸系统和神经系统无影响，无肝肾功能异常。
连花清瘟自上市以来，已进行了100多项临床研究。Meta分析显示，它在治疗流感、呼吸道感染、肺炎、新冠肺炎等疾病方面具有良好的安全性。自2021年2月上市至217项临床研究不良反应的Meta分析，涉及流感、呼吸道感染、肺炎、新冠肺炎等疾病的临床研究。结果表明，与常规药物组相比，连花清瘟或联合常规药物组的不良反应发生率降低（P＜0.001)与连花清瘟有关的肝肾功能损伤无不良反应。Meta分析中发现的连花清瘟主要不良反应与国家药物不良反应监测中心监测的恶心、腹泻、呕吐、皮疹、瘙痒等不良反应一致，体现在2019年3月以岭药业对连花清瘟药品说明书的修订中。
此外，通过检索PubMed、新冠肺炎CNKI连花清瘟共有10篇Meta分析文章。分析结果表明，在常规治疗的基础上，连花清瘟不仅在提高总效率、症状消失率和CT改善率、降低重症转移率等方面表现出确切的临床疗效，而且具有良好的安全性。连花清瘟的应用没有增加不良反应的发生率，也没有报道肝损伤不良反应。
对于无症状感染者，连花清瘟治疗新冠肺炎无症状感染者的随机对照研究表明，连花清瘟在14天隔离观察期间，核酸转阴率明显提高81.21%，核酸转阴时间比对照组缩短7天(近50%)，临床症状比例降低47.5%，普通类型比例降低51.4%，无严重不良事件记录。此外，对于密切接触者，1976例真实世界研究完成了连花清瘟前瞻性开放标签。结果表明，连花清瘟后核酸检测阳性率比对照组低76%，发热症状发生率比对照组低85%，服用连花清瘟安全性好。
