十二岁女孩晚上总有几十秒出不来气，可能有运动过度、呼吸道感染、过敏反应、支气管哮喘、先天性心脏病等原因引起的。建议及时就医，根据不同原因，在医生指导下采取针对性的一般治疗、药物治疗、手术治疗。具体分析如下：
1、运动过度：如果孩子在睡前进行了剧烈的运动，可能会导致呼吸急促和其他相关症状。建议家长鼓励孩子进行适度的运动，并在运动后给予足够的时间让身体恢复。
2、呼吸道感染：呼吸道感染会导致呼吸道分泌物增多，特别是晚上，分泌物容易残留在呼吸道内，造成呼吸道堵塞，使得呼吸不畅。可以让孩子保持半卧位或侧卧位，并轻轻拍打其背部，以帮助痰液排出，保持呼吸道通畅。如果孩子有鼻塞等问题，可以使用生理盐水滴鼻剂进行缓解。
3、过敏反应：可能导致呼吸道黏膜水肿，使得呼吸道狭窄或阻塞，从而影响呼吸。此外，过敏反应还可能导致气道平滑肌痉挛、炎症反应等，进一步加重呼吸道堵塞的情况，使得呼吸更加困难。找出过敏原并让孩子远离，以避免过敏反应加重。在医生的指导下，给孩子使用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片、马来酸氯苯那敏片等抗过敏的药物进行治疗。
4、支气管哮喘：支气管哮喘是一种慢性气道炎症性疾病，会导致气道反应性增加，引起气道痉挛、肿胀和分泌物增多等症状。在夜间，由于迷走神经的兴奋性增加，支气管平滑肌容易发生痉挛，导致气道狭窄，使得气流受限，从而引起出不来气的症状。在医生的指导下，给孩子使用沙丁胺醇气雾剂、复方异丙托溴铵气雾剂等支气管扩张剂，以缓解支气管痉挛，改善呼吸不畅的症状。
5、先天性心脏病：先天性心脏病会导致心脏的瓣膜、血管、肌肉等结构异常，使得心脏的射血功能下降，肺循环淤血，进而引起肺部的通气和换气功能严重障碍，导致呼吸困难、喘气困难等症状。如果孩子的情况比较严重，可能需要手术治疗。在医生的指导下，根据孩子的具体情况选择合适的手术方式，如经皮二尖瓣球囊成形术、房间隔缺损封堵术等。
家长应密切关注孩子的病情变化，遵医嘱治疗，同时注意孩子的饮食和生活习惯，加强个人卫生和环境卫生管理，预防疾病的发生。
